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生物样本库的质量决定精准医学成败

来源:HIT专家网    记者:谭啸

在丹麦,曾经有个研究帕金森共病现象的项目,基于大样本人群的数据收集、统计和分析,最后得到的结论之一居然是酒糟鼻——酒糟鼻患者出现帕金森症状的风险比正常人高了三四倍,这一结论出乎所有人的意料。医学大数据分析为我们带来超出想象的发现能力。

国家“十三五”规划提出了精准医学和健康医疗大数据的研究计划,再次激发了各界对生物样本收集、保存和应用的关注。在由北京嘉和美康信息技术有限公司(以下简称:嘉和美康)组织的北京重大疾病资源库专家座谈会上,大家一致认为,我国生物样本库建设优势显著,但亟待提升可持续发展能力。

质量是重中之重

毋庸置疑,质量是生物样本库的灵魂,缺乏质量的样本和临床数据对医学研究来说是致命的。据了解,目前很多国际一流期刊要求,对于以生物样本库为基础的研究成果发表,研究者必须提供所使用生物样本和临床数据的质量背景信息,以便评估成果的可信度,若研究者无法提供相关证明材料,该成果就很难予以发表。因此,样本库建设必须遵循严格的操作流程SOP(标准作业程序),对生物样本质量的控制要体现在很多细节上,包括数据、取材处理各个环节时间记录、形态复检、生物大分子稳定性分析等等。

有专家谈道,“现在国内不少大医院、研究型医院已经认识到生物样本库的重要性和必要性,都想建生物样本库,也有不少单位前来北京库参观学习,他们一般会向我们要SOP等相关文件。虽说这些文件很重要,但如果只是简单拷贝过去,那就很成问题了,因为很多内容是个性化的,跟具体的研究目的有关,不见得处处都适用。当然其中最关键的还是要把环节质控真正落到实处,然后再持续改进,否则‘多快好省’也往往意味着低效的‘面子工程’”。

近些年来,专家们一直在呼吁样本“质量”,但真正能够坚持做下来的并不多。嘉和美康副总经理、科研系统事业部总经理张雷谈道,质量评估应包括两方面:一是完整性,应该收集的东西都要收集到,包括实体样本及其对应的临床数据;二是质控措施,影响样本质量的因素有没有得到有效控制?而且要形成相应的质量证据。大家普遍认为,实体样本的质量相对容易控制,而临床数据的质量控制要困难的多,这方面最好能够充分利用医院信息系统,从源头解决问题。

如何实现可持续发展?

如前所述,当前很多医疗机构,从院领导到临床专家,都开始认识到生物样本库的重要性。其中,不少医院也成立了专门的管理部门——生物样本库中心,医院对生物样本库的建设和运营给予了一定的支持。客观来说,这应该是一笔不小的经济负担。仅以院级样本实体库来说(30-40台冻存设备左右),一年的直接运营经费至少也要三四百万元,这还仅包括水、电、人工、冰箱等硬件设备。如果再算上基础设施、相关专业支持资源,投入可谓更加可观。从长远来看,如果仅定位于支撑医院的学科发展,生物样本库到底能够坚持多久呢?如同国外生物样本库的发展一样,我国生物样本库也亟需探索出一条可持续发展的路径。

嘉和美康承建的北京儿童医院生物样本库系统截图

嘉和美康承建的北京儿童医院生物样本库系统截图

关于生物样本库的可持续发展策略,专家们认为,至少包括如下几个方面:首先是资金,仅依靠科研经费是远远不够的,最需要的还是推动样本库与医药产业的对接,以获取大量支持经费,实现“以库养库”的可持续发展;其次是人员可持续,生物样本库目前还是辅助性科室,人员不被重视,没有发展空间,大家更愿意去临床部门工作。所以,生物样本库从业者的重要性需要得到认可,其职业发展也需要给予考虑;三是生物样本库的数据能否可持续利用,“你如果使用我的样本进行分析,那么分析产生的数据原则上应该反馈回来,这样数据就可以实现滚动积累,被其他研究者重复利用,从而避免雷同的样本实验”。有专家谈道,因为生物样本资源的稀缺性,国外生物样本库都非常强调样本数据的重复利用,利用率特别高,比如,美国某个州的样本库有100多例肺癌病理组织标本,不少与肺癌相关的研究都使用过这些标本及数据,并发表了很多高水平的论文。

在专家们看来,生物样本库是个战略资源平台,是医院在其业务活动中产生的高附加值产品。但是,现在医院过于看重眼前的经济效益,而忽视了对临床数据和生物样本所蕴藏的巨大价值的开发,这无疑是一种巨大的资源浪费。据悉,很多国外的医疗机构都具有强大的新药、新产品研发能力,新的专利产品输出所创造的价值要远远超出医疗方面的收入。这无疑给我们很大的启发和借鉴。“可是,我们虽然看到了国外的先进经验,但由于国情、政策等原因,我们还是面临诸多掣肘,比如:现在医院在横向合作上日趋谨慎”。有专家如此表示,“如果只是因为担心某些人中饱私囊,而切断整个生物样本库的价值链,这恐怕是得不偿失的。”

提升生物样本库软实力的着力点:人才和随访

整合了临床和生物数据的生物样本库是一种典型的医学大数据形态,作为精准医学、转化医学的发展根基,如何提升生物样本库的软实力,是业内人士当下普遍关注的重点。在座谈会上,有两个问题被重点提及,那就是:人才和随访。

1.加强生物样本库人才队伍与激励机制建设

当前,不少医院的领导已经开始重视生物样本库建设,并尽可能提供有利条件,但实际运行效果并不理想。“其中很重要的一个原因就是没有充分调动参与者的积极性。任何一件事情想要做好都得依靠人,有一个好的团队才能把事情做好。要重视参与者的切身利益和职业发展,既要有政策层面的设计,又要配套相应的激励机制,把游戏规则先定好。”有专家如此表示。

普遍来讲,医院内生物样本库工作人员的地位、学历和收入都处于“洼地”,一方面,在职业发展上,缺乏明确的职级晋升机会。另一方面,在人才来源上,医学院里没有生物样本库的相关专业,生物样本库工作人员大多来自临床、实验室,人员稳定性很差,大家更愿意去临床锻炼和发展。

就临床研究工作来说,临床专家们往往需要三个专业助手:一是数据管理,二是研究方法,三是生物样本资源库,如果没有一个团队来帮临床专家收标本、收数据,科研工作将很难开展。某专家谈道:“我们医院曾有人建议各科室设立科研秘书这一岗位,由专职人员负责,但是院长说了,这个专职人员是保不住的,他早晚也会被安排到临床工作上,因为医生资源不够用,这是刚需。”

据专家介绍,在医院的绩效分配上,院领导通常是先把一线员工的收入留足,比如80%,剩下的20%再根据医院发展有所侧重地进行分配,比如生物样本库、党建、后勤等。从医、教、研这三者的前后顺序,我们就可以看出:‘医’是最重要的,排在第一位;‘研’则排在第三位。“生物样本库不仅是服务于科研的,而且是衔接医和研的平台,其标本和数据都是来自医,这些数据又会反过来为医所用。”专家们呼吁,应该提升生物样本库在医院内的地位。

“在实验技术层面,这些年的进展非常大,现在都是高通量、多组学的,产生的信息也愈发庞杂。比如说,我是基因方面的专家,擅长解读基因方面的数据,可如果换成蛋白组学、代谢组学的话,我就很难评判数据的质量、解读数据的含义了。”因此,专家们认为要组建一个满足多组学应用的生物样本库技术团队,才能更好地发挥生物样本库的价值。

北京嘉和美康信息技术有限公司副总经理、科研系统事业部总经理 张雷

北京嘉和美康信息技术有限公司副总经理、科研系统事业部总经理 张雷

2.随访是提升样本附加值的重要途径

“提升样本库软实力的另一个关键就是随访,如果没有随访,样本库的价值就会大打折扣”这一观点得到了专家们的一致认可。但现实情况却是,临床工作很忙,他们甚至想不起来应该在什么样的时间节点做随访;亦或是,临床科室很难有专门的人来做随访工作,大多是靠实习医生来做。所以,很多临床科室给生物样本库提建议:“你们能不能帮我们把随访做起来?”

在有些医院,并发研究项目很多,一个病人很可能会出现在不同的研究项目中,如果每个项目都要对患者进行随访,那必然会给患者带来巨大的烦扰,随访工作将难以为继。“针对这些问题,我们联合临床专家共同设计、开发了一套灵活的科研病例登记系统,在病人在院期间,完成基线数据的采集。在病人出院后,系统会按照随访条件将病人自动分组到不同的随访队列,对于交叉随访任务,系统会及时提醒随访人员,一次性地把所有问题都问完。”张雷谈道,“以前是站在科研的角度,现在则是站在临床的角度,临床医生若要增加内容,可以随时加上去。”

专家们认为,可将随访内容分成两大部分:一是共性的、辅助性的,这方面的工作大概占据了随访工作量的百分之七八十,完全可以由生物样本库中心或第三方机构来承担;二是专业性比较强的部分,也就占随访工作量的20%-30%,这部分工作只能由临床人员来承担。因此,如果有一个专职团队来帮助临床专家完成共性的、辅助性的随访工作,那将是比较好的、提高效率的解决办法。“但是,由于医院编制、人员发展等问题,在事业单位体制内很难解决这一问题,引进社会化的资金和力量是一个可以考虑的选择。”有专家如此建议。“针对医院的这一需求,我们也在探索提供第三方的随访服务。”张雷表示。

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