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【OMAHA专栏】细说SNOMED CT,您所需要了解的在这!

来源:HIT专家网    供稿:OMAHA数字医疗研究团队

近年来,随着医疗机构信息化的不断深化,各种基于实际应用的临床术语标准的需求日益增加:随着医学的发展,疾病领域越来越细分,医生临床实践的差异化越来越明显,医疗机构、科临床医学系统术语(Systematized Nomenclature of Medicine,Clinical Terms,SNOMED CT)就是一种注重语义互操作的现代西医学临床标准术语,已得到40余个国家和地区的引进,广泛应用于电子病历书写、电子处方、医嘱录入、检验报告、文献编码等工作,证明其具备了能够满足信息化临床科研工作需求的标准化特征要素。

(一)发展历程

2002年1月,SNOMED CT首次发布,它由两大医学术语SNOMED RT(Reference Terminology)与CTV3(Clinical Terms Version 3)合并而来[1],结合SNOMED RT在基础科学、实验室医学、专科和病理学方面的内容以及英国READ Codes术语有关全科医疗的工作成果,成为一部国际性、多语种、包含内容最为广泛的临床医学术语集[2]。

国际版SNOMED CT在每年的1月和7月各更新一次。SNOMED CT 已完成了与ICD-O-3、ICD-10、LOINC和The Omaha System 等多种术语集交叉映射,并开展了与国际信息交换标准如HL7(Health Level 7)、医学数字成像和通信标准(Digital Imaging and Communications in Medicine,DICOM)和可扩展标记语言(Extensible Markup Language,XML)的合作。目前SNOMED CT已发布了国际英文版、国际西班牙语版、美国版、丹麦版、加拿大英文版、加拿大法文版、瑞典版、澳大利亚版、荷兰版、英国版和乌拉圭版。

(二)内容和结构

SNOMED CT目前包括大约321 900条概念(Concept)、超过80万条临床概念相关的描述(Descriptions),和超过700万条进一步描述概念的关系(Relationships)。

SNOMED CT的主要内容包括概念表、描述表、关系表、历史表、ICD映射表和LONIC映射表。其中核心构成是:概念表(按层级结构组织的具有临床含义的概念表)、描述表(用于表达概念的人类自然语言表)和关系表(用来说明的两个临床概念之间的关系)。图1反应了各个表的组成和逻辑关系,其具体内涵在以下一一展开。

图1:SNOMED CT的逻辑模型

图1:SNOMED CT的逻辑模型

(三)关于SNOMED您需要理清的三点重要内容

 1. 本体论是SNOMEDCT的理论依据,目前形成了19个顶层概念

从2002年发布的第一版SNOMED CT到2016年的最新版,其间虽然进行了部分顶层概念的调整,但其整体上的术语集体系的构建原则并未发生变化。SNOMED CT术语分类体系的构建在学术上具有较为坚实,经得起推敲的理论基础。SNOMED CT以医学本体论作为理论依据设计了临床医学术语框架体系,其术语体系在组织结构、顶级分类设定等方面能够正确地反映现代西医学自身的固有规律。

SNOMED CT 13年版新增了顶层概念“SNOMED CT模型组件”(含4个亚类),调整后为19个顶层概念:

  • 身体结构(Body structure)
  • 临床发现(Clinical finding)
  • 环境和地理定位(Environment or geographical location)
  • 事件(Event)
  • 观察对象(Observable entity)
  • 有机体(Organism)
  • 药物/生物产品(Pharmaceutical/biologic product)
  • 物理力(Physical force)
  • 物理对象(Physical object)
  • 操作(Procedure)
  • 限定值(Qualifier value)
  • 人为记录件(Record artifact)
  • 具有明确语境的情况(Situation with explicit context)
  • SNOMED CT模型组件(SNOMED CT model component)
  • 社会环境(Social context)
  • 特殊概念(Special concept)
  • 标本(Specimen)
  • 分期与分度(Staging and scales)
  • 物质(Substance)

 2. 用描述表来指定术语和层级结构的关系,增强临床概念表达的灵活性

SNOMED CT 中共有3种术语描述类型,即“指定全称”(Fully Specified Name,FSN)、“首选术语”(Preferred)及“同义术语”(Acceptable)。每个概念都有一个“指定全称”和一个“首选术语”,同义术语是除去首选术语外,其他能够描述FSN所描述概念的术语,如图2所示。

图2:单一概念的描述样例

图2:单一概念的描述样例

 3. 通过关系表连接不同概念,形成具有内在语义关联的短句表达临床信息

关系表记录了具有临床意义的全部语义关联组合,运用丰富的连接概念,将归属于同一概念轴和不同概念轴的概念连接起来。语义关联一方面可以用来组织概念,另一方面也可以构成灵活多样的复杂概念表达方式。关联分为两类,示例如图4和图5所示:

 1)|is a|关系

 2)属性关系

图3:|is a|关系样例

图3:|is a|关系样例

图4:属性及|is a|关系定义样例

图4:属性及|is a|关系定义样例

参考文献:

[1] STEARNS M Q, PRICE C, SPACKMAN K A, et al. SNOMED clinical terms: overview of the development process and project status [C]// SNOMED clinical terms: overview of the development process and project status. Proceedings of the AMIA Symposium. American Medical Informatics Association: 662.

[2] 郭玉峰, 刘保延, 崔蒙, 等. 借鉴SNOMED CT发展中医临床标准术语集 [C]// 借鉴SNOMED CT发展中医临床标准术语集. 中医药发展与人类健康——庆祝中国中医研究院成立50周年论文集.

注:本文内容部分节选自OMAHA第二期白皮书《统一的力量:临床医学术语标准化的展望》,OMAHA授权HIT专家网发布。如需完整版白皮书,请登录OMAHA官网进行访问。或微信搜索“OMAHA联盟”公众号,回复“白皮书”获得访问链接。

下期为大家带来临床医学术语标准化实际应用案例:英国NHS诊断数据服务案例分析!敬请期待!

 

关于OMAHA2016年度第二期白皮书《统一的力量:临床医学术语标准化的展望》

在大数据时代的背景下,术语标准化有助于整合体量庞大的、分散的、非结构化的医疗信息数据。

此白皮书的发布旨在与业界分享 OMAHA 在探索医学术语标准化工作的研究成果,呼吁社会各界共同关注和参与我国的医学术语标准化工作,推动我国健康医疗信息产业的术语标准化进程。  

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关于临床医学术语标准情况的调查

近年来,随着医疗机构信息化的不断深化,各种基于实际应用的临床术语标准的需求日益增加:随着医学的发展,疾病领域越来越细分,医生临床实践的差异化越来越明显,医疗机构、科室之间的信息交换、共享、整合和利用因数据结构和表达的不同而无法达成。 术语标准化问题已经成为制约领域内信息共享和数据有意义使用的关键因素。

HIT专家网曾在”HIT专家网KOL“微信群里发起横跨昼夜的临床医学术语标准SNOMED-CT讨论,引起广泛关注。本次调查由HIT专家网联合OMAHA共同发起,目的在于了解国内HIT领域专业人士对临床医学术语标准的认知情况。

问卷调查链接:https://jinshuju.net/f/U4siXQ

问卷调查二维码:

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关于OMAHA:

开放医疗与健康联盟(Open Medical and Healthcare Alliance,OMAHA)是一个致力于推动产业开放个人健康医疗数据的非政府组织(non-government organization,NGO),希望通过协作定义个人健康档案的标准格式,探索相关信息标准的落地,从而提高老百姓对自身健康医疗数据使用的完整性、可及性和可用性,以推动医疗、健康产业信息开放、共享、开源。微信搜索“OMAHA联盟”,关注我们,让我们一起投入到这意义非凡的运动中吧!

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