拥有80年历史的珀金埃尔默：为中国医院带来数据分析“利器”

来源：HIT专家网    记者：朱小兵  陶玲

自2016年精准医学急剧升温以来，国内大多科研院校和企业大多看重精准医疗中的基因数据分析。然而，在珀金埃尔默（PerkinElmer）公司看来，基因数据只是一部分，临床数据对精准医疗更是不可或缺的一部分。1973年就进入中国的珀金埃尔默，近年来开始在中国医疗领域逐渐崭露头角。

2015年，针对医疗行业数据分析，珀金埃尔默推出了一款基于云的大数据分析管理平台 珀金埃尔默 Signals™ Perspectives。珀金埃尔默信息科学事业部中国区负责人陈其平向HIT专家网介绍，珀金埃尔默 Signals™ Perspectives平台集成了丰富的科研和临床研究数据分析功能，支持从数据采集到生物标志物等一系列完整的精准医学分析流程，为临床科研提供数据支撑服务。同时，该平台将科研与临床相结合，为患者带来更精准的治疗方案。

更为重要的是，它可以让医生摆脱对信息人员的依赖，自行使用强大的数据分析功能，开展临床数据管理和科研分析。

循证医学的精髓：获取最佳临床研究证据

陈其平说：“作为一家专注分析行业领域拥有80年历史的科技公司，珀金埃尔默凭借其大数据核心技术，为医院提供的医疗大数据整体解决方案，涵盖从组学数据分析、电子实验记录本、临床大数据分析，包括高通量分析、电子实验记录本、医疗大数据分析管理平台、医院运营决策支持系统、临床决策支持系统、单病种库等解决方案。”

对数据进行全面分析，恰恰是循证医学的核心思想，即医疗决策应尽量以客观研究结果为依据，患者治疗方案的确定、处理、医疗指南及医疗卫生决策的制定，都应依据当前最好、最新的研究结果，同时结合个人临床经验进行。

最佳临床研究证据，是指对临床研究的文献，应用临床流行病学原则和方法及有关质量评价的标准，经过认真分析与评价获得的新近最真实可靠且有临床重要应用价值的研究成果。最佳证据主要来源于设计合理、方法严谨的临床随机对照试验（RCT）研究，及对这些研究所做的Meta-分析及系统评价（Systematic review）。经专家严格筛选和评价的最佳证据，可以从Annals of Internal Medicine发表的ACPJC副刊、循证医学杂志、Cochrane图书馆、Clinical Evidence等途径获得，以指导临床医疗实践。

珀金埃尔默：为循证医学提供更多依据

陈其平介绍，珀金埃尔默Signals™ Perspectives 数据分析管理平台通过以下几个切入点，从语义分析、病理影像分析从而进行多维度数据探索，为循证医学提供了更多的“依据”和“线索”。

1.数据分析：深度学习快速提高分析命中率

过去，研究人员无法直观地利用临床数据，这使得病种识别和描述生物标志物成为一件极具挑战性的工作。珀金埃尔默Signals™ Perspectives能够加强基础研究和临床数据之间的紧密联系，确保患者与药物之间的最佳配对。

比如恶性肿瘤有几十种命名方式。珀金埃尔默有先进的疾病描述和分类智能库，可以将疾病以及与该疾病相关的描述、症状结合在一起，形成有效的数据挖掘。此外，珀金埃尔默Signals™ Perspectives提供了软件即服务（SaaS）模式，降低了医疗科研运营成本，并为其提供了强大的灵活性和可扩展性。

“例如，对疾病的命名、症状的描述多种多样，南方地区的医院和北方地区的医院有差别，甚至同一地区的不同医院也有差别。该平台系统可以在医院开展深度学习，通过对病理研究、大数据手段、机器学习等方式，分析出疾病描述使用的概率，实现对疾病多维度的认识，得到定向的反馈。”陈其平说，“要达到高效率的多维度分析，传统方法可能要花费一两年时间才能完成。而该平台通过机器学习，花费两三个月就能完成高命中率的深度学习。”

该平台支持多种数据导入方式，包括通过从剪贴板粘贴、通过拖放或打开简单的文本文件、Microsoft Excel 文件、SAS 文件、数据库或信息链接（共享数据源的预定义连接）等。此外，该平台通过内在的information Designer功能模块，实现与不同数据库的整合，可以从远程数据库中抓取实时的数据到TIBCO Spotfire® 进行分析。在江苏省某三甲医院项目中，珀金埃尔默仅仅花了四天时间就把医院五年的数据转换到平台中。“从月到天，PerkinElmer 的DSD模块加速自服务式数据源发现，实现了敏捷数据分析。”陈其平说。

2.数据展现：医生可以自行上手实现可视化多维度分析

医疗大数据分析的难点之一在于数据的挖掘和清洗，这是医院信息科非常头疼的工作。珀金埃尔默Signals™ Perspectives是一剂良药，该平台类似于ETL，但比ETL更加灵活，可以自动建立关联，让医院信息科能够与临床科室更紧密高效地协同工作。

传统的BI报表形式能够实现明确需求的数据分析，不要求提供即时更改，只需要环比、同比的分析。而医学科研不同，每个课题、每篇文章的数据支撑都有不同维度的数据分析，需要可视化的变化。如果按照报表方式来做，就还需要开发团队在背后支撑。

以前，一个科研项目需要找几个学生来寻找这些维度的病历，耗时漫长，而且出错率也高，科研意义价值低。珀金埃尔默Signals™ Perspectives能够根据医院科研的实际需求，整合医院各种信息系统，包括HIS、LIS、PACS、EMR等，将其中的非结构化数据通过知识本体和信息提取的方式转化为结构化数据，并且可以结合原有的结构化数据做科研方面的多维度数据分析。数据在平台中自动关联，自动定期更新，自动抽取和处理数据。平台支持多级权限，保证主数据的安全性，支持动态安全，在不影响原有架构的同时动态部署权限。一个平台能够支持几百个维度分析，并且分析出各个维度之间的显著相关性。而且，这一切无须专业信息人员的辅助。临床医生经过简单培训，就能掌握平台的使用技能，自己动手实现不同维度分析，节省了大量的医院人力成本和时间成本。

可视化还需要高可用性。该平台可实现上亿条数据的实时在线可视化分析，实时改变维度，响应不同维度下的数据变化。该平台能够提供多种图表，帮助用户更好地展现数据的变化规律，这也是传统报表分析工具无法比拟的。

3.定量病理学：加速科研分析

在文本分析之外，临床医生和科学家还需要进行样本的病理学分析。在转化肿瘤学中，了解不同微环境中的癌症特点，是识别疾病亚型、验证靶标、选择患者进行试验、描述疗效和反应特征以及确定与临床预后的相关性的核心所在。

珀金埃尔默已获专利的自动图像分析软件包，可以准确地定量组织切片中的生物标记物，能够在单细胞水平进行免疫组化、免疫荧光和原位 RNA 杂交分析，而且允许在单个和多重实验中对微弱的光谱重叠标记物进行分离和测定。inForm专业定量病理分析软件使用已获专利的“自学习”算法自动对特定组织类型进行检测、分割，该软件就像一名专业病理学家，通过鉴别组织的形态模式来找到特定的组织类型，大大降低了临床科研对病理医生的依赖。

与三甲医院合作开展临床数据分析

江苏省某三甲医院经过了近20年的信息化建设，管理着海量的临床数据，如何利用好这些沉睡的无形资产？从2015 年 10 月 31 日起，江苏省所有三甲医院取消了15%的药品加成。当时，医院管理层十分担忧整体收益是否会下降。为此，医院希望设计一个软件系统，用于分析取消药品加成政策对医院收入、成本等各方面产生的影响和变化。

于是，珀金埃尔默为该院搭建了集成HIS系统和电子病历系统的院长驾驶舱——医疗运营决策系统，帮助院领导实时了解医院的运营情况。同时，帮助医院配置KPI考核系统，分析及统计医院整体及各个部门的KPI指标，帮助科室主任了解各个科室的运作情况。此外，还帮助医院建设了基于临床数据中心的科研分析平台，打通医院各系统的数据，利用数据的快速展现和文本处理技术，帮助科研部门掌握精准的临床数据，大大提高科研效率，将临床医生从繁重的临床数据分析中解脱出来。

目前，在临床数据挖掘和分析领域，珀金埃尔默公司已经跟国内很多厂商进行合作，同时也提供直销服务，已经为江苏、上海、安徽、宁夏等地的大型三甲医院开始提供临床数据挖掘与分析的解决方案。展望未来，陈其平表示，“从临床大数据入手，珀金埃尔默将把自身在全球范围积累的精准医疗整体解决方案带进中国。”

背景链接：珀金埃尔默在中国

珀金埃尔默（PerkinElmer）成立于1937年，由两家标准普尔 500 公司的业务部门合并而成，公司的理念是“为一个更健康的世界而不断创新”。

公司主要涉及两大业务版块：一是诊断业务，为医院、实验室、临床医师和医学研究专业人员提供仪器、试剂、测试平台和软件，支持早期更准确的评估和诊断，从而更有效的进行治疗和疾病预防，帮助人们延长寿命并享受更健康的生活。二是探索与分析解决方案业务（Discovery & Analytical Solutions），涵盖在信息科学领域，凭借先进、成熟的大数据核心技术和丰富的实施服务案例，提供大数据整体信息化解决方案。在生命科学领域，提供包括生物学影像系统、体外检测方案、定量病理学研究平台和信息学应用在内的完整的试剂和检测技术解决方案，为基础疾病研究乃至新药物开发与分析提供全面支持。实验室服务方面，专注于为全球各地、各行业领域内、各类实验室提供多品牌仪器维修、维护、校准、验证，Lab IT及实验室搬迁的一站式服务解决方案。同时，在环境健康领域，提供从放射性和有机物污染监测、微量有毒金属和化学品检测等相关的专业知识、和全面的服务。以及在食品安全领域中提供对于食品的真实性、品质、营养和安全性的检测解决方案和全面的服务。

在全球布局中，珀金埃尔默在北美、欧洲专注于精准医疗，为跨国药企及实验室提供精准医疗和筛查解决方案。而在中国，珀金埃尔默为医院临床科研服务带来了全球临床科研分析服务的经验，积极参与到医院主导的精准医疗科研项目。

全球战略的转变，带给珀金埃尔默中国战略新变化。中国一直是珀金埃尔默最为重视的市场之一。2009年和2012年，珀金埃尔默连续在中国收购了一家医学诊断技术供应商和一家分子诊断筛查技术公司，新波生物和上海浩源，并于2014年在中国开设了首家独立医学实验室。2012年，珀金埃尔默进一步加大了对中国的投入，在上海的中国区总部新大楼设立客户体验中心(以下简称CKC)、全球软件研发团队和全球应用开发中心。在最近的2016年第四财季，PekinElmer在中国市场取得了高位增长。

“基于中国用户需求，为中国用户提供‘本土化’的解决方案”将是未来几年珀金埃尔默在中国的发展战略。

【责任编辑：孙鹏】